智能温室可以通过加温或降温使棚内温度适于作物生长，但由于与外界大气隔绝，也有两个不利因素：一是降低了日光透射率；二是影响了与外界的气体交换。而大气中的二氧化碳是植物进行光合作用的碳源。在一定范围内光合作用的强度随着二氧化碳浓度的提高而提高。智能温室中的作物在夜间通过呼吸作用吸收氧气，放出二氧化碳，因此清晨智能温室内二氧化碳浓度较高；太阳升起后，作物见到阳光又开始进行光合作用，随着光合作用的加强，很快消耗掉大量的二氧化碳，尤其是在午间，午间光合作用旺盛造成二氧化碳不足，因此此时二氧化碳浓度成为光合作用的主要约束条件，出现所谓的光合作用“午休”现象。
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